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開業医は「儲けすぎ」は本当か?年収の実態・経営コスト・収益改善策を医師目線で徹底解説

2026年07月15日

「開業医は儲けすぎ」というイメージが広まっている一方、実際には経営に苦しむクリニックも少なくありません。本記事では、開業医の平均年収・診療科別の差・勤務医との収入比較から、固定費や人件費などの経営コストの実態、収益を守るための経営戦略まで徹底解説します。開業を検討している勤務医、経営改善を目指すクリニック経営者の方に必読の内容です。

目次

「開業医は儲けすぎ」というイメージはどこから来るのか

「開業医は儲けすぎ」「クリニックの院長は高収入」——そんなイメージを持つ人は少なくありません。このイメージが生まれる背景には、いくつかの要因があります。

まず、開業医の「売上(診療収入)」と「所得(手取り)」が混同されがちな点です。厚生労働省の「医療経済実態調査」では、診療所の年間収入(医業収益)が公表されますが、これはあくまで売上であり、そこから人件費・家賃・設備費・医薬品費などを差し引いた「院長の所得」とは大きく異なります。

次に、勤務医時代の給与と比べたときの「表面的な数字の差」です。勤務医が年収1,500万円であっても、開業後の総収入が4,000万円台となれば、一見「大幅アップ」に見えます。しかし開業医はその収入から、スタッフ給与・家賃・医療機器リース・保険料・ローン返済など多岐にわたる経費を自ら負担しなければなりません。

さらに、一部の自由診療に特化したクリニックや、人気の高い立地で繁盛している診療所が「高収入の開業医」の代名詞として語られることで、全体像が歪んで伝わっているという側面もあります。

この記事では、「開業医 儲けすぎ」というキーワードが示す読者の疑問に正面から向き合い、実態データをもとに開業医の年収と経営コストを徹底的に解説します。

数字で見る開業医の年収実態:平均・中央値・分布

厚生労働省データが示す開業医の所得

厚生労働省の「医療経済実態調査」をベースにすると、診療所の院長(開業医)の年間医業収益(売上)は平均で1億円前後というデータが示されています。ただし、ここから経費を差し引いた「損益差額(院長の所得に相当する部分)」は、平均で約2,500万〜3,000万円程度とされています。

一方、勤務医(病院に所属する医師)の平均年収は、約1,200万〜1,500万円程度(病院の規模・診療科・役職などにより大きく変動)とされています。

この数字だけを見れば、開業医の所得は勤務医の2倍前後になることが多く、「儲けすぎ」と言われても不思議ではない差があります。

↓ 開業医の実態が気になる方はこちらの資料もご覧ください。

資料閲覧はこちら:開業前に知っておきたい開業医の実態 2025年最新 アンケート調査

診療科別・地域別で大きく変わる開業医の年収

診療科別の年収傾向

開業医の収入は、診療科によって大きな差があります。以下は、一般的な傾向の目安です。

年収が高くなりやすい診療科

- 美容外科・美容皮膚科:自由診療が中心で単価が高く、月商1,000万円を超えるクリニックも存在
- 眼科:白内障手術などの件数が安定しており、外科処置の点数が高い
- 整形外科:リハビリ患者が多く、継続通院が見込める
- 内科(生活習慣病専門):患者数が多く、継続的な通院が期待できる

年収が伸びにくい・安定しにくい診療科

- 小児科:患者単価が低い傾向があり、患者数も地域の子ども人口に左右される
- 産婦人科:分娩対応をする場合はリスクも高く、スタッフ確保が課題
- 精神科・心療内科:継続通院は多いが、診療報酬単価が比較的低め

ただし、これはあくまで傾向であり、同じ診療科でも経営手腕・立地・患者数・自由診療比率などによって大きく変わります。

地域別の年収格差

地方クリニックと都市部クリニックでは、年収の性質が異なります。

都市部(東京・大阪・名古屋など)
- 競合が多く、集患が難しい
- 家賃・人件費が高い
- ただし自由診療ニーズや富裕層患者が多い

地方・郊外エリア
- 競合が少なく、近隣の住民を安定的に集患できる
- 運営コスト(家賃・人件費)が低い
- 医師偏在対策として、地方開業への公的支援(補助金・優遇措置)が拡充されている

↓ 医師偏在対策とクリニック開業への影響が気になる方はこちら

資料閲覧はこちら:厚労省が、新規開業に一部規制? 今話題の「医師偏在対策」とは 現在の動向をチェック

開業医が「儲けすぎ」と言われる3つの理由

開業医が「儲けすぎている」というイメージを持たれがちな背景には、主に以下の3つの理由が存在します。

① 売上(診療収入)と所得(院長の手取り)が混同されている

最も大きな要因は、クリニック全体の「売上(医業収益)」が、そのまま院長個人の「手取り(所得)」だと誤解されている点です。 ニュースや統計などで「開業医の収入は数千万円〜1億円超」と報じられることがありますが、これはあくまで事業としての売上高に過ぎません。実際にはその売上から、スタッフの人件費、高額な医療機器のリース代やローン返済、テナント家賃、医薬品の仕入れなど、多額の経費を支払う必要があります。そのため、最終的な院長個人の手取り額は、表面的な売上の数字とは大きく異なります。

② 経費計上や医療法人化による「税制上のメリット」が大きい

勤務医と比較して、開業医(個人事業主や医療法人)は経費計上の自由度が高く、これが「実質的な収入が多く見える」要因となっています。

③ 一部の「繁盛・自由診療クリニック」が代表例として語られている

メディアやSNSなどで「高収入な医師」として頻繁に取り上げられるのは、美容医療やAGA治療など、単価設定が自由な自由診療に特化したクリニックや、都心の一等地で大成功を収めているごく一部の繁盛クリニックです。 これらは独自のマーケティングで高い収益を上げていますが、全国の大半を占める「地域密着型の保険診療を中心とするクリニック」の収益構造とは大きく異なります。こうした一部の極端な成功例が「開業医の代表例」として世間に広まることで、全体像が大きく歪んで伝わってしまっているのが実情です。

知られざる開業医の支出と経営コストの実態

開業時にかかる初期費用の全体像

「開業医は儲かる」と言われますが、そもそも開業には多額の初期投資が必要です。

一般的な内科クリニックの場合の費用感は以下の通りです。

※m3.com内アンケートより作成(アンケート実施:2025年4月実施 対象者:m3.com会員 458名 方法:Webアンケート)

大型の設備を導入したり自己所有ビルに開業したりする場合は、1億円を超えることも珍しくありません。
多くの開業医が金融機関からの借入を活用しますが、返済期間は10〜15年にわたることもあり、開業後の収入から毎月の返済を続ける必要があります。

↓ クリニックの開業費用の相場をもっと詳しく知りたい方はこちら

資料閲覧はこちら:2026年最新版 クリニック開業費用相場レポート

ランニングコストは「見えにくい」が大きい

毎月かかる固定費は、開業医の経営を圧迫する最大の要因のひとつです。以下は主要なランニングコストの一例です。

【人件費】
クリニック経営において最も大きな固定費が人件費です。看護師・准看護師・医療事務・受付スタッフを合わせると、月額数百万円以上になることもあります。特に看護師の採用・定着は開業医共通の課題であり、高水準の給与を維持しなければ離職リスクが高まります。

【家賃・リース費】
医療モール・駅前テナント・ロードサイドなど立地によって大きく異なりますが、月額50万〜200万円以上になるケースも珍しくありません。医療機器のリース料も合算すると、月の固定費だけで大きな金額になります。

【医薬品・診療材料費】
内科・小児科などでは処方薬・医薬品費が売上の10〜20%前後を占め、整形外科や眼科ではさらに高くなる場合があります。薬価改定のタイミングで収益が変動するリスクも考慮が必要です。

【IT・システム費】
電子カルテ・レセコン・予約システム・オンライン診療ツールなど、デジタル化に伴うコストも増加傾向にあります。クラウド型のサービスを活用すれば初期費用を抑えられますが、月額費用は継続して発生します。

赤字クリニックは珍しくない!経営の厳しい現実

3分の1の診療所が赤字という現実

「開業医は儲けすぎ」というイメージとは裏腹に、診療所の約3分の1が赤字経営であるという調査結果が存在します。特に、開業初期・患者数が安定しない時期・診療報酬改定のタイミングでは、収益が急激に悪化するリスクがあります。

引用:厚生労働省 医療機関等を取り巻く状況について_令和7年8月17日(2025/10/14時点での参照)

資料閲覧はこちら:1/3の診療所が赤字という結果に 診療所経営の現状と対策についてご紹介

赤字・経営難になりやすいパターン

開業医が経営難に陥るケースには、いくつかの共通したパターンがあります。

パターン①:立地選定のミス
周辺人口・競合クリニックの数・アクセスのよさを十分に調査せずに開業した結果、患者数が想定を大幅に下回るケース。特に「雰囲気が気に入った」「自宅から近い」といった感覚的な理由での物件選定は危険です。

パターン②:過剰な設備投資
「最新機器を揃えれば患者が来る」と考え、必要以上に高額な医療機器を導入した結果、リース・ローン返済が重くなり経営を圧迫するケース。機器は診療科のニーズに合った必要最低限から始め、患者数の増加に応じて追加するのが基本です。

パターン③:人員計画の失敗
患者数に対して多すぎるスタッフを雇用してしまい、人件費が収益を超過するケース。逆に、少なすぎるスタッフで現場が回らず、患者満足度が下がって口コミ・評判が悪化するケースもあります。

パターン④:診療報酬改定への対応遅れ
2年に1度実施される診療報酬改定では、算定要件や点数の見直しが行われます。新設された加算や要件変更を見落とすことで、本来受け取れるはずの収益を取りこぼすリスクがあります。

開業医が高収入を維持・改善するための経営戦略

戦略①:患者単価と患者数の両輪を強化する

クリニックの収益は「患者数 × 患者単価」で決まります。どちらか一方に頼るのではなく、両方を伸ばす戦略が重要です。

患者数を増やす取り組み
- SEO対策・Googleビジネスプロフィールの最適化
- 口コミ管理(満足度向上→自然な口コミ増加)
- 地域連携(近隣の薬局・病院・介護施設との紹介ネットワーク形成)
- Web予約・オンライン問診の導入による新規患者の利便性向上

患者単価を上げる取り組み
- 加算の適切な算定(生活習慣病管理料・各種指導料・電子的診療情報連携体制整備加算など)
- 任意接種・自由診療メニューの追加(インフルエンザ・コロナ・旅行者ワクチンなど)
- 予防医療・健康診断メニューの充実

戦略②:診療報酬改定を味方にする

2026年の診療報酬改定では、医療DXの推進や在宅医療の強化に関連した加算が新設・拡充されています。特に注目されるのがベースアップ評価料です。この加算はスタッフの処遇改善を目的としていますが、適切に算定することで医院の収益安定にも寄与します。

↓ ベースアップ評価料の概要・算定要件を詳しく知りたい方はこちら

資料閲覧はこちら:2026年診療報酬改定で話題 ベースアップ評価料とは? -概要・種類・点数・届出について解説-

戦略③:医療法人化で節税・事業承継を視野に入れる

年収が一定水準(目安として所得2,000万円超)を超えてきたら、医療法人化を検討する価値があります。

医療法人化のメリットは次の通りです。

- 節税効果:個人の累進課税よりも法人に課される税率(法人税・住民税・事業税等の合計)の方が低くなるケースがあり、税負担の軽減につながる可能性があります
- 社会的信頼性の向上:法人格を持つことで取引や融資が有利になる場合がある
- 事業承継のしやすさ:後継者への継承や分院展開がスムーズになる
- 退職金の活用:役員退職金を活用した節税が可能

ただし、医療法人化には設立コスト・維持コスト・決算申告の手間が増えるデメリットもあります。税理士・医療コンサルタントへの相談を通じて、自院の状況に合った判断をすることが重要です。

戦略④:集患・患者定着のための広告・マーケティング活用

クリニック経営において「黙って待っていれば患者が来る」時代は終わりつつあります。競合クリニックが増加する中、意識的な集患努力が不可欠です。

一方で、医療機関の広告には医療広告ガイドラインがあり、誇大広告・虚偽広告は厳しく規制されています。SEO・ホームページ・SNS・チラシなど各媒体で何がOKで何がNGかを正確に把握した上で広告戦略を立てましょう。

業務効率化・DX導入で収益力を底上げする方法

なぜ業務効率化が収益に直結するのか

クリニック経営では、「診療時間を増やす」「患者数を増やす」以外にも、業務の無駄を減らしてコストを下げる・スタッフの生産性を上げることで実質的な収益改善が期待できます。

特に次の業務効率化は効果が大きいとされています。

- 電子カルテ・レセコンの効率化:入力時間の短縮・レセプト作成の自動化
- AI・音声入力の活用:カルテ記載の時間削減をサポート
- オンライン予約・Web問診の導入:電話対応・紙問診票の手入力を削減
- キャッシュレス決済の導入:現金管理・釣り銭対応の工数削減
- オンライン診療の導入:来院不要の再診患者対応でスタッフ負荷を軽減

エムスリーデジカルによる業務効率化の実例

電子カルテシェアNo.1(m3.com調査・2025年1月)のエムスリーデジカルは、クリニックの業務効率化と収益改善をサポートするクラウド型電子カルテです。

AIによる診察支援
患者・医師ごとのよく使用するオーダーをAIが学習し、リスト表示することで入力時間の短縮をサポートします。さらにオプションのAIエージェント機能では、診察時の会話や音声入力をリアルタイムで解析し、カルテの自動ドラフト作成や所見のサマリー化を支援します。これにより、診察後のカルテ入力時間の削減が期待できます。

レセコン一体型で算定漏れのリスクを軽減
レセプトコンピュータが標準搭載されているため、診療行為の入力からレセプト作成までスムーズに連携します。加算の取りこぼし防止をサポートし、適切な診療報酬請求に貢献します。

「デジスマ診療」との連携でフロント業務を一元化
予約・Web問診・受付・会計・キャッシュレス決済を一つのシステムで管理できる「デジスマ診療」と連携することで、受付スタッフの負担軽減や患者の待ち時間短縮、満足度向上に貢献します。

※一部サポートや機能については有料オプションとなる場合があります。詳細はお問い合わせください。

月額費用(税別)の目安
- ORCA連動型:月額11,800円〜
- レセコン一体型:月額24,800円〜
- 初期費用:0円〜

開業計画に必要な事前準備

収益を最大化しながら失敗リスクを最小化するために、開業前に必ず確認しておきたい事項を以下にまとめます。

立地選定
- 対象エリアの人口・高齢化率・競合クリニック数のリサーチ
- 駅・バス停・駐車場へのアクセス確認
- テナント型か、戸建て型か、医療モール型かの選択

資金計画
- 初期費用・ランニングコストの精緻な試算
- 日本政策金融公庫・地方銀行などからの融資計画
- 開業後6〜12ヶ月分の運転資金の確保

人材確保
- 看護師・医療事務スタッフの採用計画(開業3〜6ヶ月前から開始が理想)
- 給与水準・働きやすい職場環境の整備

↓ クリニック開業の手順と費用相場を体系的に学びたい方はこちら

資料閲覧はこちら:診療所開業マニュアル-開業の手順と費用相場を解説-

よくある質問(FAQ)

Q1. 開業医の年収は本当に勤務医の2倍以上になるのか?

平均値だけを比較すると、開業医の所得(損益差額)は勤務医の平均年収の2倍前後になるケースが多いのは事実です。ただし、開業医の所得には人件費・家賃・ローン返済などが差し引かれる前の数字も含まれており、「実質的な手取り」は見かけほど大きくないことも多いです。また、診療科・立地・患者数によって個人差が非常に大きく、勤務医と大差がない、またはそれ以下というケースも存在します。

Q2. 開業医が「儲けすぎ」と言われる主な理由は何か?

主な理由は次の3点です。①売上(診療収入)と所得(院長の手取り)が混同されること、②医療法人化・経費計上による節税が可能なため「実質的な収入」が表面上の数字より多く見えること、③一部の自由診療特化型クリニックや繁盛クリニックが「開業医の代表例」として報道されることで、全体像が歪んで伝わること、が挙げられます。

Q3. 開業してから年収が安定するまでどのくらいかかるか?

一般的には、開業後1〜3年で患者数が安定してくるケースが多いとされています。ただし、立地・診療科・集患戦略によって大きく異なります。開業当初の運転資金として、少なくとも6〜12ヶ月分の固定費相当額を確保しておくことが推奨されます。

Q4. 医療法人化するタイミングはいつが適切か?

一般的な目安として、個人の所得が1,500万〜2,000万円を超えてきたタイミングが法人化を検討する転換点とされることが多いです。ただし、法人化に伴う設立費用・毎年の決算申告コスト・社会保険料の変化なども考慮する必要があります。また、適切なタイミングや効果は個々の経営状況によって異なるため、医療専門の税理士・会計士への相談を強く推奨します。

Q5. 診療報酬改定が開業医の収入に与える影響は?

診療報酬改定は2年に1度実施され、算定できる点数・加算の新設・廃止・要件変更が行われます。改定内容を把握し、自院で算定可能な加算を漏れなく届け出ることが収益に直結します。電子カルテやレセコンのシステム更新対応も重要で、改定に対応した最新システムを導入することで算定ミスや取りこぼしのリスク軽減につながります。

Q6. クリニック経営の赤字を防ぐために最も重要なことは何か?

多くの専門家が指摘する最重要事項は「開業前の徹底的な事業計画と資金計画」です。立地選定・競合調査・患者数予測・コスト試算を慎重に行い、最悪のシナリオを想定した上で十分な運転資金を確保することが基本です。開業後は、月次の収支管理・患者数の推移確認・定期的な診療報酬算定の見直しを継続することが安定経営の鍵となります。

Q7. 電子カルテ・ITシステムの費用は経費として計上できるか?

はい、電子カルテ・レセコン・予約システム・オンライン診療ツールなど、診療に関連するITシステムの費用は、医院の経費として計上できます(個人事業主・医療法人いずれの場合も)。具体的な計上方法や減価償却の扱いについては、担当の税理士にご確認ください。

Q8. 自由診療と保険診療を組み合わせるメリット・デメリットは?

メリット:保険診療の制約を受けない自由設定の料金で高単価を実現できる可能性があります。特定ニーズ(美容・予防・アンチエイジング等)を持つ患者層を獲得できる。

デメリット:患者の全額自己負担となるため集患が難しく、マーケティング投資が必要。医療広告ガイドラインに沿った宣伝・表現の管理が必要。保険診療との複合診療(混合診療)には制約があるため、ルールの理解が不可欠。

まとめ:「儲けすぎ」の実態は複雑——正確な理解と経営戦略が重要

「開業医 儲けすぎ」という言葉の背景には、収入構造への誤解・一部クリニックの事例の一般化・税制上の優遇措置への誤った認識などが複合しています。

実態を整理すると、次のことが言えます。

- 開業医の平均所得は勤務医より高い傾向があるが、経費・返済・税負担を差し引くと「実質的な差」は縮まる
- 診療科・立地・患者数・経営戦略によって個人差が非常に大きく、赤字クリニックも3割程度存在する
- 高収入を維持・向上させるには、診療報酬の適切な算定・集患戦略・業務効率化・コスト管理が不可欠
- 電子カルテや予約・問診システムなどのDXツールは、業務効率化と患者満足度向上を通じて収益改善に貢献できる

開業を検討している勤務医の方にとっても、すでに経営しているクリニック院長の方にとっても、「年収の数字」だけでなく「経営の実態」を正確に理解した上で戦略を立てることが、長期的な経営安定の第一歩です。

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